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基于智能基因计算的癌症精准诊疗

11612022/04/06
基本信息
  • 成果类型 高等院校
  • 委托机构 西安电子科技大学
  • 成果持有方 西安电子科技大学
  • 行业领域 计算机科学与技术
  • 项目名称 基于智能基因计算的癌症精准诊疗
  • 知识产权 发明专利
  • 项目简介 (一)项目背景

    1.行业急需:我国人口基数大,癌症患者人数众多,当前存在医疗不准确或过度医疗现象,癌症精准诊疗是医学的迫切需求,并上升为国家战略, 而个体化癌症基因突变分析是癌症精准诊疗的关键环节,那么构建先进的智能基因计算方法必不可少,可以极大地推动该行业的快速发展。
    2.市场空间大:2013 年全球癌症诊断市场规模达1010 亿美元,预计2024年全球癌症诊断市场规模将达 1686 亿美元,可见,行业市场空间庞大;当前国内外已有机构及企业开展了癌症基因检测及分析业务,但存在基因变异检测不全面,靶向药物挖掘范围有限,检测周期长、成本高等主要短板, 本项目研究技术具有针对性地解决上述短板,其市场机会及前景广阔。
    3.国家支持:根据国家首次召开的精准医学战略专家会议上提出的中国 精准医疗计划,到 2030 年前,我国将在精准医疗领域投入 600 亿元。基因检测与分析作为精准医疗的基础,即将获得政策层面的大力支持。同时, 根据发改委发布的《国家发展改革委关于实施新兴产业重大工程包的通知》, 我国将在 3年时间内建设 30 个基因检测技术应用示范中心,快速推进基因检测临床应用以及基因检测仪器试剂的国产化。
    4.可持续发展:本项目是“四个面向”的典型体现,即“面向世界科技前沿、面向经济主战场、面向国家重大需求、面向人民生命健康”,早日推动市场化,具有可持续性。

    (二)项目简介

    癌症精准诊疗是通过分析个人基因突变为癌症患者制定个性化治疗方案,本项目采用先进的智能机器学学习理论及算法,构建基因计算模型及系统,VarDDT,其能够采用高通量测序数据实现癌症基因组多种变异检测及靶向药物定位,即能够全面、高效地检测单位点变异(SNP)及结构性变异(包括拷贝数变异,插入/缺失,融合基因,倒置及易位),并依据这些变异准确定位癌症靶向药物,从而到达精准医疗目的。VarDDT 的 panel 涵盖404 种癌症药物且在不断扩展。VarDDT 能够利用癌组织单样本测序检测多种变异,无需癌旁组织的测序数据,使得整体成本下降。与其他方法相比,VarDDT 具有准确度高、检测效率高等特点。

    (三)关键技术

    利用有限的数据实现高质量的检测:在仅有癌症组织测序数据及测序深度不高的情况下,准确检测癌症靶向关联的突变基因;即采用深度学习于统计模型相结合方式建立智能算法,能够实现在测序深度为 2X 情况下, 基因拷贝数变异检测敏感度可高达 95%以上,后天获得性基因突变检测敏感度高达 90%以上。
    癌症靶向药物挖掘能力强:针对检测的癌症突变基因,充分挖掘相关的靶向药物是一关键环节;尽管目前市面上有几百种针对不同突变基因的靶向药物,但对于不常见的癌症突变基因,靶向药物并不充分;本项目从两个角度突破该关键技术,一是构建基因突变的生物功能分析模型及大数据挖掘算法,利用动态扩增的药物库,从中筛选针对性的药物;二是构建治疗性单克隆抗体的发现与设计系统,推动靶向药物的研发与投产。
    并发计算能力强:在超规模样本数据情况下,设计具有高效并行能力的智能计算方法,提高检测效率;即从两个方面着手,一是从设计具备并行处理大规模数据的智能算法,而是借助我们现有的高性能计算平台,能够实现单天 2000G(约 100 个样本)数据的并行运行。
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交易信息
  • 意向交易额 面议
  • 挂牌时间 2023/04/06
  • 委托机构 西安电子科技大学
  • 联系人姓名 苏老师
  • 联系人电话 13991958837
  • 联系人邮箱 51978575@qq.com
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产学研交流:15802954800

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